戶用沼氣池由于日常管理疏漏，影響了沼氣池效益的發揮，甚至許多質量完好的沼氣池也因此放棄使用，造成了資金的浪費。以下是根據基層調查研究和工作實踐積累的見聞，總結出戶用沼氣池日常管理的常見問題，并提出相應的解決辦法。
1．不能堅持每天小進小出原料和及時補充原料。許多農戶在初次投入原料后由于種種原因不再補充新原料，因而3個月左右便無氣可產。正確的方法是每天小進小出原料，即產氣一個月后每天從出料口挑出1～2擔的沼液，同時將2～3頭豬的糞便沖入沼氣池，補充適量的清水至出料口原有液面。這樣做的好處有兩個：一是產氣均衡持久；二是變集中的大強度勞動為分散的低強度勞動。使沼氣池日常管理變得輕松簡單。
2．冬季沼氣池要采取保溫和增溫措施。沼氣發酵的生物學下限溫度是15℃，所以，在寒冷的冬天，沼氣池幾乎不產氣。必須要有保溫或增溫措施，才能促進沼氣池在冬天產氣。如在主池上蓋草或搭塑料小棚、將沼氣池建在塑料大棚內、使用騾馬、牛糞等熱性原料，適量補充熱水等等，都能有效提高產氣率。
3．沒有攪拌的習慣是沼氣產量低、不能滿足日常生活需要的主要原因。攪拌能使原料與接種物混合均勻，增加發酵接觸面，發酵溫度也均勻一致，提高沼氣產量。攪拌方法可污水泵回流攪拌，或用木桿從進、出料管振搗攪拌，也可從出料間一次性提取1～2擔料液，從進料口一次性注入進料管內等辦法達到攪拌的效果。
4．不同原料要采取不同的預處理方法。預處理對于加快發酵啟動，提高發酵原料的利用率具有重要的意義。秸桿要鍘短和堆漚；青草要曬；禽糞要沉淀除去砂石；牛糞要除去長草。很多原料還要調酸、解毒和調節濃度。
5．冬季所建沼氣池啟動緩慢，接種物不經過馴化培養的現象普遍存在。沼氣發酵的菌種有許多個區系，不同的發酵基質菌種區系肯定不同，所以，菌種必須經過馴化培養富集才能使用。具體的方法是將1/3的原料與污泥混合堆漚3～4天，再與余下的原料混合入池。當然冬季沼氣池的啟動還需要熱水拌料，原料預處理，接種物的數量還要相對增加，適當補充氮素，保溫與增溫措施要增強等等。這樣的處理可以使沼氣池在24～48小時內啟動并維持較高的產氣水平。
6．趨于惡化的發酵狀況進行及時調控。正常發酵的出料口沼液呈醬油色，且泡沫豐富；沼液略偏酸或出口料液泛綠時要停止進料，等待恢復正常或掏出一部分干物質,補充清水以降低發酵濃度；如果更酸或出料口料液呈黑色且有白膜則應加入適量的澄清的草木灰水或碳酸氫鈉溶液,并補充更多的接種物；出口料液呈灰色表明發酵濃度偏低，應及時補充干物質。如果坐視這些情況不加處理，沼氣池發酵狀況惡化就會加劇，直至停止產氣。
7．輸配系統不維護檢修，缺乏必要的保護措施。脫硫劑不還原、不更換；有的輸氣管不安裝集水瓶和套管，也不進行深埋保溫，傾斜度不標準等。這些問題應該盡快糾正。
8．沼氣在使用時不進行燃燒火焰調控，熱效率較低。正確的燃燒是內焰與外焰的交界處正好位于鍋底，外焰散開平鋪于鍋底，火焰呈藍色。火焰偏長就要減少供氣量；偏短或燃燒內縮就要增加供氣量；火焰呈黃色就要調大風門。
9．安全意識差，存在隱患。進出料口沒有蓋或有蓋不用；進出主池不進行通風換氣和動物試驗；人經常離開正在燃燒的沼氣灶；輸氣管道旁邊常有人畜活動甚至點火。
